Hóa đơn điện tử khởi tạo từ máy tính tiền có kết nối với cơ quan thuế được xem là hóa đơn hợp pháp để khấu trừ thuế GTGT đầu vào và tính trừ khi xác định thu nhập chịu thuế thu nhập doanh nghiệp. Lợi ích việc xuất hóa đơn điện tử từ máy tính tiền là không nhỏ. Tuy nhiên trong thực tế, triển khai thí điểm số lượng người nộp thuế chuyển đổi sang hình thức này còn thấp với tâm lý chờ đợi quy định bắt buộc.

Cục Thuế TP. Hà Nội đang rà soát, thống kê danh sách người nộp thuế thuộc 5 nhóm kinh doanh, bán lẻ để lựa chọn sử dụng hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế khởi tạo từ máy tính tiền. Hiện đã có gần 6000 doanh nghiệp và hộ kinh doanh thuộc diện triển khai trong giai đoạn 1

Sau gần 1 tháng vận hành về hệ thống hóa đơn điện tử khởi tạo từ máy tính tiền, cả nước có hơn 800 cơ sở kinh doanh đăng ký sử dụng. Con số tham gia ít như vậy là do chưa có quy định pháp lý nào mang tính bắt buộc. Các đơn vị tham gia triển khai chủ yếu được cơ quan thuế khuyến khích động viên.

Hà Nội đang đẩy mạnh sử dụng hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế khởi tạo từ máy tính tiền. Trên thực tế thì đây chưa phải là quy định bắt buộc nên không ít doanh nghiệp, hộ kinh doanh vẫn có tâm lý e ngại, chưa sẵn sàng chuyển đổi. Trong khi đó, tại những đơn vị đã triển khai, các lợi ích của khởi tạo hóa đơn điện tử từ máy tính tiền bước đầu được ghi nhận.